ÖZ

Amaç

Alzheimer hastalığı (AH), sinsi başlayan ve yavaş ilerleyen, prevalansı yaşla birlikte giderek artan nörodejeneratif bir hastalıktır. Önceki bir çalışmada, deneysel olarak doğrulanmış miRNA-hedef etkileşim veritabanlarını tarayarak next-generation sequencing verilerinden elde edilen AH’li hastalarda plazma eksozomal dairesel RNA (circRNA)-mikro RNA’lar (miRNA) ekspresyon profillerini araştırdık. Mevcut makale, önceki çalışmamızın çıktısını kullanarak circRNA-miRNA ve RNA bağlayıcı proteinin (RBP) plazma eksozomlarına entegrasyonunu hesaplamaya odaklandı.

Yöntemler

Önceki makalemizden 24 yukarı regüle edilmiş circRNA ve 12 aşağı regüle edilmiş miRNA tanımladık. Bunlar daha sonra circMine web sunucusu ve MiRNet aracılığıyla circRNA-miRNA’nın tahminine tabi tutuldu. Daha sonra, 24 circRNA’yı RBP’lerle entegre etmek için circRNA Interactome web sunucusu kullanıldı. Son olarak elde edilen sayısal ölçek sonuçları R studio kullanılarak görselleştirilerek bulgularımızın geçerliliği ve güvenirliği sağlanmıştır.

Bulgular

Hesaplamaların genel bir sonucu olarak, AH patolojisine bağlı sorgulanmış 24 circRNA’dan CNTN4, SH3BGRL, THOC2, CGGBP1, FLNA, ATP6V1A ve UBN1 bulundu.

Sonuç

Temel olarak hesaplamalarımız, bu komplekslerin AH’de sünger miRNA gibi davranıp davranmadığının incelenebileceğini iddia etmektedir.